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標題: [香港] 推算結果實驗驗證科大大數據分析病毒助研發抗愛滋疫苗 [打印本頁]

作者: qqonqq 時間: 2018-2-8 07:53 AM 標題: 推算結果實驗驗證科大大數據分析病毒助研發抗愛滋疫苗

科技大學研究團隊利用大數據分析愛滋病病毒，其中一種關鍵蛋白適宜存活的度數，有助日後針對該病毒蛋白的弱點，研發對抗愛滋病病毒的疫苗。團隊根據過去五年收集近二千個患者，超過二萬個蛋白序列樣本，並通過實驗證實其推算的適存度結果。研究成果日前於《美國國家科學院院刊》發表。記者余嘉欣
香港愛滋病病毒感染個案自上世紀八十年代一直呈上升趨勢，截至去年九月，本地累積呈報個案近九千宗，全球於一六年估計超過三千六百萬人受感染。然而，因為愛滋病病毒能通過突變，以逃避防止病毒感染的抗體依附，醫學界至今仍未研發有效的愛滋病病毒疫苗。
科大電子及計算機工程學系副教授Matthew McKay和學系研究助理教授雷可業的團隊，過去五年利用大數據，收集並分析逾一千九百名愛滋病病毒帶菌者，逾八百個蛋白殘基及二萬個蛋白序列樣本，並研發方程式，計算組成愛滋病病毒尖刺上一種名叫「gp160多蛋白」的適存度，即該蛋白組裝、複製和傳播感染的能力。. T( g9 s" {/ L8 G& W4 e) y
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McKay教授表示，科學家掌握以上資料後，便可針對適存度較弱的病毒蛋白，研究可破壞該致命病毒的疫苗，逼使該病毒變異成不健康的形態，最終枯竭死亡，這樣便可阻止或限制病毒感染。
團隊用作計算病毒蛋白適存度的電腦方程式，亦通過生物實驗的驗證。McKay教授指，結合實驗和電腦方程式計算的數據，發現兩者具高關聯性（high correlation）。他表示，方程式可辨識突變率高且多樣化的病毒，如丙型肝炎病毒，相信對日後研發該病毒的疫苗亦有幫助。
今次研究涉及龐大的數據，有近四百四十萬個參數。因為計算病毒尖刺的蛋白序列，比起其他蛋白長兩倍以上，變化幅度亦最大，故當中的運算更複雜和具挑戰性。
雷可業指，若沒有大數據技術輔助，將難以成事。該研究成果上月於國際權威科學期刊《美國國家科學院院刊》發表。

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